Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGA4Q8IV77 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNGA4Q8IV77 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms