Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS6Q8IU80 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS6Q8IU80 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.3 ms