Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP4Q86YS3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
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