Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HAPLN4Q86UW8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HAPLN4Q86UW8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms