Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTOP1Q7RTM1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms