Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SV2AQ7L0J3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SV2AQ7L0J3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms