Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCNI2Q6ZMN8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNI2Q6ZMN8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNI2Q6ZMN8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms