Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARA5Q6ZMJ2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARA5Q6ZMJ2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA5Q6ZMJ2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA5Q6ZMJ2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA5Q6ZMJ2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA5Q6ZMJ2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA5Q6ZMJ2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA5Q6ZMJ2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA5Q6ZMJ2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARA5Q6ZMJ2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms