Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCBE1Q6UXH8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCBE1Q6UXH8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms