Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP7

LCLAT1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCLAT1Q6UWP7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms