Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDF2Q6PJF5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms