Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFXN4Q6P4A7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SFXN4Q6P4A7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SFXN4Q6P4A7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SFXN4Q6P4A7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SFXN4Q6P4A7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms