Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LLGL2Q6P1M3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LLGL2Q6P1M3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 294.4 ms