Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS38

ALKBH2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH2Q6NS38 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALKBH2Q6NS38 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ALKBH2Q6NS38 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms