Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
B4GALNT3Q6L9W6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
B4GALNT3Q6L9W6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms