Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT80Q6KB66 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms