Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WSCD1Q658N2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WSCD1Q658N2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms