Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALS2CLQ60I27 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms