Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CACHD1Q5VU97 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
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