Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRAMEF5Q5TYX0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms