Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBAP2Q5T6F2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms