Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0L3

SPATA46, Spermatogenesis-associated protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA46Q5T0L3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPATA46Q5T0L3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPATA46Q5T0L3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPATA46Q5T0L3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPATA46Q5T0L3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SPATA46Q5T0L3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPATA46Q5T0L3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPATA46Q5T0L3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPATA46Q5T0L3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPATA46Q5T0L3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPATA46Q5T0L3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPATA46Q5T0L3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPATA46Q5T0L3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPATA46Q5T0L3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPATA46Q5T0L3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPATA46Q5T0L3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPATA46Q5T0L3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPATA46Q5T0L3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPATA46Q5T0L3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPATA46Q5T0L3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPATA46Q5T0L3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms