Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAN3Q58A45 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAN3Q58A45 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms