Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COBLL1Q53SF7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COBLL1Q53SF7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COBLL1Q53SF7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms