Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COX19Q49B96 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms