Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SV2CQ496J9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SV2CQ496J9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms