Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LSM12Q3MHD2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LSM12Q3MHD2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LSM12Q3MHD2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms