Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PROX2Q3B8N5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms