Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CTU2Q2VPK5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTU2Q2VPK5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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