Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NKPD1Q17RQ9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NKPD1Q17RQ9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms