Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPROQ16827 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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