Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTN1Q16799 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
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