Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 ABHD5-201ENST00000013894 833 ntTSL 315.24■□□□□ 0.039e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 SLTM-206ENST00000480144 2277 ntTSL 211.32□□□□□ -0.69e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 ABHD5-204ENST00000456453 876 ntTSL 410.49□□□□□ -0.739e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 SLTM-212ENST00000557924 3021 ntTSL 29.72□□□□□ -0.859e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 MSH5-209ENST00000450148 1000 ntTSL 59.57□□□□□ -0.889e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 MSH5-214ENST00000468602 637 ntTSL 39.36□□□□□ -0.919e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 MSH5-213ENST00000468136 690 ntTSL 28.78□□□□□ -19e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 SLTM-220ENST00000559880 717 ntTSL 38.43□□□□□ -1.069e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 SLTM-226ENST00000628684 1040 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.119e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 SLTM-202ENST00000380516 4147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.139e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 SLTM-208ENST00000492526 3022 ntTSL 27.33□□□□□ -1.249e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 MSH5-219ENST00000497269 764 ntTSL 25.83□□□□□ -1.489e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 SLTM-217ENST00000558756 896 ntTSL 54.84□□□□□ -1.639e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 SLTM-215ENST00000558486 585 ntTSL 44.84□□□□□ -1.639e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 SLTM-201ENST00000249736 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 54.64□□□□□ -1.679e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 SLTM-219ENST00000559305 559 ntTSL 44.13□□□□□ -1.759e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 SLTM-224ENST00000560682 495 ntTSL 33.95□□□□□ -1.789e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-210ENST00000581608 2387 ntTSL 217.51■□□□□ 0.392e-24■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-221ENST00000585274 984 ntTSL 514.17□□□□□ -0.142e-24■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-218ENST00000583744 539 ntTSL 411.84□□□□□ -0.512e-24■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-205ENST00000578236 3277 ntTSL 211.15□□□□□ -0.632e-24■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-231ENST00000557336 580 ntTSL 38.52□□□□□ -1.051e-12■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-213ENST00000554891 644 ntTSL 58.13□□□□□ -1.111e-12■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-218ENST00000555215 781 ntTSL 57.74□□□□□ -1.171e-12■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-228ENST00000557033 760 ntTSL 37.63□□□□□ -1.191e-12■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-224ENST00000556226 629 ntTSL 57.63□□□□□ -1.191e-12■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-216ENST00000555137 789 ntTSL 37.43□□□□□ -1.221e-12■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-207ENST00000553614 604 ntTSL 56.99□□□□□ -1.291e-12■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-233ENST00000557768 599 ntTSL 34.84□□□□□ -1.631e-12■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 HNRNPC-217ENST00000555176 531 ntTSL 52.91□□□□□ -1.941e-12■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.331e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.141e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.281e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.351e-6■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 ENO1-202ENST00000464920 2266 ntTSL 1 (best)11.04□□□□□ -0.646e-10■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.676e-10■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 ENO1-206ENST00000497492 647 ntTSL 29.83□□□□□ -0.846e-10■□□□□ 10.4
SRSF7Q16629 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.049e-8■□□□□ 10.3
SRSF7Q16629 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.239e-8■□□□□ 10.3
SRSF7Q16629 LUC7L3-214ENST00000508482 1597 ntTSL 210.46□□□□□ -0.749e-8■□□□□ 10.3
SRSF7Q16629 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.079e-8■□□□□ 10.3
SRSF7Q16629 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.42e-14■□□□□ 10.3
SRSF7Q16629 PNN-204ENST00000554902 583 ntTSL 24.93□□□□□ -1.622e-14■□□□□ 10.3
SRSF7Q16629 PNN-206ENST00000557680 912 ntTSL 34.27□□□□□ -1.732e-14■□□□□ 10.3
SRSF7Q16629 ASGR1-205ENST00000573083 855 ntTSL 38□□□□□ -1.137e-7■□□□□ 10.3
SRSF7Q16629 RAD21-201ENST00000297338 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.144e-8■□□□□ 10.3
SRSF7Q16629 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.574e-8■□□□□ 10.3
SRSF7Q16629 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.74e-8■□□□□ 10.3
SRSF7Q16629 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.94e-8■□□□□ 10.3
SRSF7Q16629 MALAT1-208ENST00000616527 572 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.333e-54■□□□□ 10.3
SRSF7Q16629 MALAT1-216ENST00000620465 333 ntTSL 23.87□□□□□ -1.796e-54■□□□□ 10.3
SRSF7Q16629 LUC7L3-219ENST00000511974 507 ntTSL 34.68□□□□□ -1.662e-7■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.041e-7■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.021e-7■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.171e-7■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 IMMP2L-210ENST00000492938 587 ntTSL 39.79□□□□□ -0.841e-7■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 IMMP2L-203ENST00000437687 243 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.921e-7■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.951e-7■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 IMMP2L-206ENST00000452753 421 ntTSL 58.06□□□□□ -1.121e-7■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 RBM25-205ENST00000527432 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.161e-7■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.411e-7■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 RBM25-207ENST00000528081 3008 ntTSL 24.92□□□□□ -1.621e-7■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 RBM25-212ENST00000532683 6848 ntTSL 1 (best)4.88□□□□□ -1.631e-7■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 GUSBP11-201ENST00000422506 2055 ntTSL 218.26■□□□□ 0.512e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 GUSBP11-205ENST00000452737 1662 ntTSL 1 (best)17.98■□□□□ 0.472e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 C1RL-207ENST00000539927 354 ntTSL 215.08■□□□□ 02e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.122e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.162e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.43□□□□□ -0.262e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 GUSBP11-204ENST00000451837 3234 ntTSL 1 (best)12.69□□□□□ -0.382e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 GUSBP11-203ENST00000445682 3350 ntTSL 211.98□□□□□ -0.492e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.52e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.62e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.653e-9■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.792e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 PLXNB1-205ENST00000461261 851 ntTSL 59.27□□□□□ -0.933e-8■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 C1RL-204ENST00000534969 532 ntTSL 39.16□□□□□ -0.942e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 C1RL-205ENST00000537833 561 ntTSL 39.16□□□□□ -0.942e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 C1RL-209ENST00000543941 539 ntTSL 38.92□□□□□ -0.982e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 C1RL-208ENST00000543933 592 ntTSL 58.67□□□□□ -1.022e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.032e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 C1RL-211ENST00000545280 449 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.142e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.492e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 CCAR1-216ENST00000543706 869 ntTSL 56.59□□□□□ -1.358e-7■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 CCAR1-210ENST00000539250 701 ntTSL 25.08□□□□□ -1.68e-7■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 VEGFA-211ENST00000476772 1683 ntTSL 1 (best)24.13■■□□□ 1.457e-11■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 17e-11■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.989e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.897e-11■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.887e-11■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.767e-11■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.759e-6■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.737e-11■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.737e-11■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.737e-11■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.737e-11■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.737e-11■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.737e-11■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.737e-11■□□□□ 10.2
SRSF7Q16629 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.737e-11■□□□□ 10.2
Retrieved 100 of 5,030 protein–RNA pairs in 344.9 ms