Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF239Q16600 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF239Q16600 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms