Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMA4Q16363 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMA4Q16363 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
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