Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SNCBQ16143 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNCBQ16143 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNCBQ16143 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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