Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAMP3Q15836 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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