Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JMJD1CQ15652 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JMJD1CQ15652 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms