Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TAF11Q15544 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF11Q15544 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF11Q15544 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF11Q15544 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF11Q15544 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF11Q15544 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF11Q15544 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF11Q15544 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF11Q15544 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF11Q15544 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TAF11Q15544 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF11Q15544 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF11Q15544 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF11Q15544 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF11Q15544 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF11Q15544 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF11Q15544 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TAF11Q15544 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms