Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SURF1Q15526 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SURF1Q15526 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms