Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHHQ15465 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHHQ15465 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHHQ15465 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHHQ15465 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHHQ15465 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHHQ15465 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHHQ15465 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHHQ15465 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHHQ15465 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHHQ15465 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHHQ15465 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHHQ15465 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHHQ15465 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SHHQ15465 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHHQ15465 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHHQ15465 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHHQ15465 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHHQ15465 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHHQ15465 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHHQ15465 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHHQ15465 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SHHQ15465 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHHQ15465 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHHQ15465 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHHQ15465 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SHHQ15465 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SHHQ15465 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHHQ15465 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHHQ15465 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHHQ15465 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHHQ15465 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHHQ15465 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHHQ15465 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHHQ15465 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHHQ15465 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHHQ15465 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SHHQ15465 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHHQ15465 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHHQ15465 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHHQ15465 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SHHQ15465 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHHQ15465 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHHQ15465 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHHQ15465 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHHQ15465 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHHQ15465 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SHHQ15465 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHHQ15465 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SHHQ15465 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHHQ15465 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHHQ15465 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHHQ15465 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHHQ15465 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SHHQ15465 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHHQ15465 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHHQ15465 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHHQ15465 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHHQ15465 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHHQ15465 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHHQ15465 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHHQ15465 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHHQ15465 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SHHQ15465 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHHQ15465 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHHQ15465 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHHQ15465 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHHQ15465 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHHQ15465 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHHQ15465 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHHQ15465 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHHQ15465 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHHQ15465 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHHQ15465 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHHQ15465 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHHQ15465 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SHHQ15465 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHHQ15465 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHHQ15465 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHHQ15465 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHHQ15465 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHHQ15465 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHHQ15465 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHHQ15465 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHHQ15465 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHHQ15465 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHHQ15465 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHHQ15465 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHHQ15465 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHHQ15465 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SHHQ15465 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SHHQ15465 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHHQ15465 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHHQ15465 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SHHQ15465 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHHQ15465 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHHQ15465 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHHQ15465 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHHQ15465 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHHQ15465 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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