Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SEC23BQ15437 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC23BQ15437 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC23BQ15437 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC23BQ15437 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC23BQ15437 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC23BQ15437 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC23BQ15437 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC23BQ15437 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC23BQ15437 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEC23BQ15437 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC23BQ15437 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC23BQ15437 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC23BQ15437 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC23BQ15437 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC23BQ15437 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SEC23BQ15437 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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SEC23BQ15437 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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SEC23BQ15437 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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SEC23BQ15437 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC23BQ15437 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC23BQ15437 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC23BQ15437 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC23BQ15437 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC23BQ15437 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC23BQ15437 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEC23BQ15437 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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