Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDK1Q15118 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDK1Q15118 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms