Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC7Q15024 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC7Q15024 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC7Q15024 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC7Q15024 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC7Q15024 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC7Q15024 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC7Q15024 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC7Q15024 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC7Q15024 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC7Q15024 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC7Q15024 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC7Q15024 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC7Q15024 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC7Q15024 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC7Q15024 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC7Q15024 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC7Q15024 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms