Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCARB2Q14108 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCARB2Q14108 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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