Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFAIP1Q13829 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNFAIP1Q13829 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
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