Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATP1A4Q13733 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP1A4Q13733 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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