Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRF5Q13568 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRF5Q13568 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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