Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3AQ13472 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3AQ13472 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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