Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3BQ13214 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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